Ανυπόστατη και παραπλανητική χαρακτηρίζει ο ΚΟΑΠ τη διαρροή πληροφοριών περί απαίτησης της Τρόικας για διάλυση του και μεταφορά των αρμοδιοτήτων του στο Υπουργείο Περιβάλλοντος και Αγροτικής Ανάπτυξης.
Ο ΚΟΑΠ διευκρινίζει ότι τα όσα είδαν το φως της δημοσιότητας αποτελούν λανθασμένη ερμηνεία ενός από τα διαφορετικά σενάρια που προτάθηκαν στο πλαίσιο μελέτης που διεξήγαγε η Διεθνής Τράπεζα, κατόπιν σχετικής ανάθεσης από την Κυπριακή Κυβέρνηση. Η έκθεση της Διεθνούς Τράπεζας περιέχει εισηγήσεις που δεν είναι δεσμευτικές και είναι η Κυβέρνηση που θα αποφασίσει αν και ποιες τελικά εισηγήσεις της Διεθνούς Τράπεζας θα υιοθετήσει.
Σύμφωνα με την έκθεση της Διεθνούς Τράπεζας, στα 22 από τα 28 κράτη μέλη, οι Οργανισμοί Πληρωμών λειτουργούν εκτός των Υπουργείων Γεωργίας. Επιπρόσθετα, στην έκθεση αναφέρεται ότι ο Οργανισμός αντιπροσωπεύει μόλις το 3% των συνολικών εξόδων του Υπουργείου Περιβάλλοντος και Αγροτικής Ανάπτυξης και έχει μειώσει τον προϋπολογισμό εξόδων του αισθητά τα τελευταία χρόνια, ενώ η οργάνωση του ικανοποιεί όλες τις απαιτήσεις της Ευρωπαϊκής Νομοθεσίας.
Το θέμα της ανεξαρτησίας του Οργανισμού Πληρωμών, απασχόλησε και παλαιότερα τις αρμόδιες αρχές και ειδικά κατά το χρόνο ίδρυσης του το 2003, όταν η Βουλή των Αντιπροσώπων και η ίδια Ευρωπαϊκή Επιτροπή τοποθετήθηκαν ξεκάθαρα στην ανάγκη δημιουργίας ανεξάρτητου, αυτόνομου και ευέλικτου Οργανισμού Πληρωμών. Γι’ αυτό και στο νόμο του αναφέρεται ότι ο Οργανισμός δεν υπάγεται σε κανένα Υπουργείο. Αυτή η ανεξαρτησία και αυτονομία του ΚΟΑΠ, βοήθησε την Κύπρο να απορροφήσει πέραν του 95% των διαθέσιμων για τη χώρα μας Ευρωπαϊκών κονδυλίων και σχεδόν να εκμηδενίσει τις δημοσιονομικές διορθώσεις (πρόστιμα), κάτι που αποτελεί σημαντικότατο επίτευγμα στον τομέα αυτό. Από την ίδρυση του ο ΚΟΑΠ διέθεσε πέραν του €1,2 δις επιδοτήσεων, οι οποίες πλέον διενεργούνται με ποσοστό Ευρωπαϊκών κονδυλίων που ξεπερνά το 75%.